作为一部侧重心理悬疑而非大场面的剧集，《灵魂医师》的制作预算主要投入在场景氛围营造上。睿康研究中心的设计偏向冷峻科技感，符合悬疑调性。特效方面相对写实，主要用于展现主角心理幻觉或记忆闪回片段，未出现夸张玄幻元素。部分观众认为室内布景精致，但个别外景地略显普通，整体中规中矩。

作为热门小说IP改编作品，《灵魂医师》在保留原著核心悬疑架构的同时，对部分配角线和情节节奏进行了影视化调整。书粉讨论焦点多集中在心理诊疗案例的呈现是否够专业以及反派动机是否合理。整体来看，剧集在视觉化和戏剧冲突上做了适配，但个别原著党认为删减了某些深层心理剖析内容，属于常规改编取舍。